Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM4AO75164 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms