Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLXNC1O60486 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms