Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIAA0556O60303 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms