Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIAH2O43255 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms