Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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