Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01387J3KSC0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms