Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms