Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4E171 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4E171 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4E171 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4E171 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4E171 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4E171 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4E171 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4E171 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4E171 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4E171 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms