Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF839A8K0R7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF839A8K0R7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms