Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms