Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD3L3A6NE82 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1374.2 ms