Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms