Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-27A0A075B6S5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms