Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms