Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms