Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FZD4Q9ULV1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms