Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMCC3Q9ULS5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms