Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms