Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIMA1Q9UHB6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms