Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms