Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS29Q9UBQ0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms