Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms