Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms