Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSKIPQ9P0R6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSKIPQ9P0R6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms