Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UFSP2Q9NUQ7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UFSP2Q9NUQ7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms