Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC22A11Q9NSA0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms