Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms