Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms