Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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LHX9Q9NQ69 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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LHX9Q9NQ69 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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LHX9Q9NQ69 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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LHX9Q9NQ69 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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LHX9Q9NQ69 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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LHX9Q9NQ69 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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LHX9Q9NQ69 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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