Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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