Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB18Q9NP72 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms