Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP74Q9C0B2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP74Q9C0B2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms