Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms