Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP3-1Q9BYR8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP3-1Q9BYR8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms