Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms