Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms