Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms