Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCMBPQ9BTE3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms