Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TINF2Q9BSI4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TINF2Q9BSI4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms