Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms