Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms