Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARXQ96QS3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms