Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms