Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms