Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms