Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms