Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCANQ96GW7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
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