Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP4Q96EB1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms