Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms