Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms